Services
Unser aktuelles Angebotsspektrum umfasst eine große Bandbreite moderner Sequenzierungsverfahren und Microarray-basierter Applikationen. Mit Hilfe der Bioinformatik werden die gewonnen Daten aufgearbeitet und bereitgestellt. In verschiedenen Kursen wird das nötige Know-how für die Datenauswertung an unsere Nutzer vermittelt.
Für jegliche Anfragen zu unseren Services nutzen Sie bitte unser Incident-Formular.
- Unterstützung bei der Antragstellung
- Beratung zum Studiendesign
- Bereitstellung von Rechenkapazität
- Beratung zu inhaltlicher Datenauswertung
- Bereitstellung kommerzieller Auswertesoftware
- Bioinformatische Datenauswertekurse
- Unterstützung bei Datenintegration in öffentliche Datenbanken
- Single-cell RNA-Sequenzierung
- RNA-Sequenzierung (nach ribosomaler Depletion)
- RNA-Sequenzierung (nach poly-A-Anreicherung)
- RNA-Sequenzierung (kleine Input-Mengen oder stark degradierte Ausgangsproben)
- smallRNA-Sequenzierung
- microRNA-Sequenzierung (Nachweis reifer microRNAs)
- Microarray-basierte mRNA-Expressionsstudien
- RNA-Qualitätskontrolle
- DNA-Qualitätskontrolle
- Whole-Genome-Sequenzierung
- Exom-Sequenzierung
- Amplikon-Sequenzierung
- Target-Enrichment-Sequenzierung
- Metagenomik
- ChIP-Sequenzierung *
- Epigenetische Analysen *
* Bislang wurden noch keine expliziten Standards etabliert. Die Art der Zusammenarbeit ist individuell zu vereinbaren. Chip-Seq-Ergebnisse sind viel relevanter, wenn eine unterstützende Technologie wie RNA-Seq oder ein Methylierungsassay auf den gleichen Proben verwendet wird.
Einige der bioinformatischen Leistungen stellen keine Standardservices dar und können jeweils nur bei entsprechender Kapazität und gesonderter Vereinbarung durchgeführt werden.
- Transcriptom-Alignment und Quantifizierung (RNA-Seq)
- Microarray-Auswertung
- De novo Assembly (Genome, Transcriptome)
- SNP Detection
- Bisulfit-Auswertung
- Vergleichende Visualisierung im Genome Browser
- Bereitstellung und Administration einer zentralen Galaxy-Instanz als Datenauswerteplattform
- Bereitstellung von hoher Rechenleistung für NGS-Applikationen durch einen zentralen Hochdurchsatz Rechencluster (HPC-seq Cluster) (zusammen mit den Stakeholdern und dem ZIMt)
Unser Team blickt auf eine langjährige Erfahrung zurück. In unserer Funktion als primär serviceorientierte Forschungseinrichtung sind wir bemüht, Ihre Forschungsvorhaben in bestmöglicher Weise zu unterstützen und mit Ihnen gemeinsam umzusetzen.
Weitere ausführliche Informationen sind in der Evaluierung der RCUG im Juni 2017 zu finden.